Вопрос:
Где и как хранятся файлы локального кэша данных?

Ответ:
Кэширование аутентификатора происходит в момент аутентификации по нему при доступном сервере Indeed-Id и включенном разрешении на использование кэширования в настройках пользователя в оснастке ADUC. Кэшированные аутентификаторы хранятся в виде файлов с расширением .dat в папке:

• \Documents and Settings\All Users\Application Data\Indeed-ID\Objects\Users - если используется операционная система Microsoft Windows XP или Microsoft Windows Server 2003;

• \ProgramData\Indeed-ID\Objects\Users - если используется операционная система Microsoft Windows 7, 8 или Microsoft Windows Server 2008, 2012.

Данные аутентифкатора хранятся в файле в зашифрованном виде. Шифрование производится стандартными средствами операционной системы (Data Protection application programming interface (DPAPI) - https://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms995355.aspx)